Os principais projetos do ISSB receberam reconhecimento e notoriedade através do:
Prêmio Empreendedor Social Ashoka
& McKinsey 2005
O Projeto do Selo “Práticas de Pesca Ambientalmente Responsáveis” foi finalista (10 melhores dentre 456 projetos) deste Prêmio que objetiva apoiar o desenvolvimento de negócios inovadores e capacitar Organizações da Sociedade Civil (OSCs). O Prêmio colaborou para o planejamento e confecção do Plano de Negócios do Selo, aliando sustentabilidade, geração de receitas e impacto social para as comunidades tradicionais de pescadores.
Prêmio Superinteressante de Ecologia 2002
A iniciativa de capacitar voluntários, técnicos e comunidades litorâneas para agir em derrames de óleo, conferiu ao Projeto “Ações para Salvar Animais Marinhos em Derrames de Óleo” o 2o lugar na Categoria Fauna do Prêmio Superinteressante de Ecologia promovido pela Editora Abril.